Teilprojekt C.8
Molekulardynamik-Simulationen zur Bestimmung von Entfaltungspfaden und stabilen Konformationen von DNA G-Quadruplexen
Wir beschäftigen uns mit der Stabilität und den Entfaltungspfaden von DNA-Strukturen, insbesondere den sogenannten DNA G-Quadruplexe, die in den letzten Jahren in der molekularbiologischen Forschung vermehrt für Aufmerksamkeit gesorgt haben.
In atomistischen Molekulardynamik-Simulationen wollen wir freie Energielandschaften ermitteln, die Aufschluss über die relative Stabilität dieser Strukturen geben sollen. Desweiteren soll auch der Einfluss verschiedener Metallkationen wie einwertiger Natrium- und Kaliumionen untersucht werden und der Einfluss verschiedener Osmolyte wie Harnstoff und Hydroxyectoin auf die Entfaltungspfade als auch auf die freien Energielandschaften abgeschätzt werden.
Weitere Informationen über dieses Teilprojekt