Teilprojekt D.6
GPU-beschleunigte MD
Wie können Simulationen effektiver berechnet werden?
Ziel dieses Teilprojektes ist die Entwicklung von Simulationsalgorithmen für die systematische Untersuchung der Keimbildung - die frühe Phase des Kristallwachstums - in Systemen mit geladenen Teilchen wie etwa Proteinen.
Dazu werden effiziente Methoden für Systeme mit großen Teilchenzahlen, insbesondere Grakkarten (GPU)-gestützte Algorithmen entwickelt. Besonderes Augenmerk gilt dabei den rechenzeitintensivsten Wechselwirkungen, die in diesen Molekulardynamik-Simulationen eingesetzt werden, nämlich Hydrodynamik und Elektrostatik. Diese sollen so weiterentwickelt werden, dass sie auf massiv-parallelen Architekturen (z.B. GPUs) effizient skalieren.
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